Dentro de la agricultura, se pueden encontrar microrganismos benéficos, pero también se hallan aquellos que son fitopatógenos las cuales llevan a pérdidas de cosecha, varios casos dentro de la agricultura en superficies de campo se encuentran las bacterias Ralstonia sp, Xanthomonas sp. y en postcosecha las más comunes son Erwinia sp, además de algunas especies de Pseudomonas.
Para la propagación de estos microorganismos muchas de las ocasiones se deben a factores mecánicos lo cual resulta total atención por lo que se toman medidas de limpieza de herramientas de trabajo y superficies para evitar o tener como objetivo de control de los mismas.
El amonio cuaternario, se tiene como compuesto químico clasificado dentro de los tensoactivos catiónicos, existen cinco generaciones de amonios cuaternarios donde las más importantes son la tercer y cuarta, esta última generación destaca por tener mejor efecto como desinfectante.
La utilización de sales cuaternarias resulta ser efectiva para la desinfección de herramientas de trabajo y superficies debido a que penetran las membranas de microrganismos, las cuales provocan alteraciones graves afectando su permeabilidad, así mismo el ingrediente activo se introduce en el interior de la célula microbiana teniendo como consecuencia una desnaturalización de proteínas como efecto secundario.
El manejo de los amonios cuaternarios suele tener un efecto residual, por lo cual no se recomienda la aplicación en frutas y hortalizas, se utiliza más como método de sanitización en las cuales se emplean en tapetes sanitizantes, recipientes en los cuales se sumergen herramientas de trabajo de campo o postcosecha tales como: recipientes, cuchillas u otras herramientas, etc. En Fagro Post Harvest Solutions contamos el desinfectante Purex AC que es un producto a base de sales de amonio cuaternarios para el control y/o eliminación de microorganismos patógenos de superficies en campo o invernadero, además de ser bactericida ejerce su acción como biocida debido que funciona como fungicida e inactivador de virus.